Whole Genome Seq解析サービス

特長

既知ゲノム配列を利用したリシーケンス解析サービスです。ハイエンドシーケンサー Illumina NovaSeq6000での解析でコストパフォーマンスに優れたシーケンスデータを提供します。

解析方法

DNA-Seq解析フロー
DNA-Seq解析フロー

ゲノムDNAを断片化し、ショットガンシーケンシングを実施します。解析対象となる生物種に応じてデータ取得量を決定します。ヒトの場合では150bpペアエンドシーケンス解析、取得データ量は90Gb(ゲノムカバレッジ約30倍)を推奨しています。
データ解析においては、既知のゲノム配列(リファレンス配列)にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。
ヒトの場合は変異解析以外にも、染色体の構造変異、コピー数変異の解析が可能です。

解析結果

【遺伝子変異解析】

遺伝子変異解析例
遺伝子変異解析例

各染色体部位において検出した遺伝子変異情報(SNP, short InDel)をエクセルファイルにて報告します。変異情報としては①変異を検出した染色体部位(染色体番号、塩基番号)②変異情報(標準/変異塩基配列情報、シーケンス頻度)③変異箇所の遺伝子情報(遺伝子名、各種データベースID、変異頻度など)となります。

【コピー数変異解析】

コピー数変異解析例
コピー数変異解析例

コピー数変異を検出した染色体領域、コピー数変異情報をエクセルファイルにて報告します。

【構造変異解析】

構造変異解析例
構造変異解析例

構造変異を検出した染色体領域、構造変異情報(逆位・転座などの変異情報)をvcfファイル形式にて報告します。

ご注意

※シーケンス解析のみをご依頼の場合には、FASTQファイルでの納品となります。上記はデータ解析を依頼いただいた場合の結果例です。

必要サンプル条件

ゲノムDNA 3.0μg以上(濃度 50ng/μl以上)

ご注意

※サンプルはヌクレアーゼフリー水に溶解してください

※電気泳動にて10~20 kbに単一のバンドが検出されていることをご確認ください。DNAの分解などによってスメア状になっている場合は解析をお受けすることができません。

※DNAの定量はQubit Fluorometerなどの蛍光法による測定データをご利用ください。NanoDropなどの吸光度による測定データは過大評価される恐れがあります。

解析費用

解析費用は「ライブラリ調製~シーケンス解析」、「データ解析(ご希望の場合)」、「ハードディスク」より構成されます。
お問い合わせフォームよりご希望の生物種、解析検体数、データ解析有無のご希望をお知らせください。

納期

サンプルお預かりより約2か月

ご依頼方法

解析依頼書の確認事項に同意・捺印いただいた上で、ご所属・ご氏名・サンプル情報などの必要事項をご記入いただき、サンプルと合わせてお送りください。

解析依頼書はこちら

サンプル送付方法

サンプルは十分量のドライアイスを同梱し、下記宛先まで冷凍便にてお送りください。

〒572-0823
大阪府寝屋川市下木田町14-5
クラボウ寝屋川テクノセンター3F
クラボウ バイオメディカル部
遺伝子受託解析グループ 宛
TEL 072-820-3093

詳しい送付方法はこちら

※弊社では土日・祝日のサンプル受け取りはできませんので、避けてお送りください。

※サンプルの返却につきましてはお受けできません