GeneChip解析サービス

特長

サーモフィッシャーサイエンティフィック社の遺伝子発現解析用マイクロアレイGeneChip®を用いた受託解析サービスです。GeneChip®は光リソグラフィ法による製造で高密度マイクロアレイを実現しています。DNAマイクロアレイのデファクトスタンダードとして世界中の研究者に認知されており、コスト面やデータハンドリング面においても網羅的遺伝子発現解析における有力な解析ツールです。
解析結果はクラボウ独自のソフトウェア「Transcriptome Viewer」でご報告します。マイクロアレイデータの取り扱いが初めてという方にも、クラスタリングなどのグラフ作成、統計解析による発現変動遺伝子の抽出を簡便に行うことができます。

クラボウはサーモフィッシャーサイエンティフィック社認定の受託解析サービスプロバイダーで、15年以上に渡り国内での受託実績を持っています。熟練の解析担当者による安定したデータをお客様にお届けします。

マイクロアレイ種の選択

遺伝子発現解析用GeneChipプローブ配置図
遺伝子発現解析用GeneChipプローブ配置図

遺伝子発現解析用GeneChipは多彩なラインナップで構成されています。長年多くの研究者に利用されてきた「3’IVT Array」、Non-coding RNAの解析も可能な「Gene ST Array」、安価で最新の遺伝子情報が反映された「Clariom S Array」、エクソン単位・ジャンクション部位の発現解析可能でアウトプットデータ数が最大の「Clariom D Array」です。
それぞれのアレイには特長がありますので、お客様のニーズに応じたラインナップを選択いただくことができます。

miRNA解析用アレイ(miRNA 4.0 Array)はmirBase release 20に基づいてプローブデザインが設計されており、全203生物種のmiRNAを検出することができます。ヒト・マウス・ラットにおいてはmiRNA前駆体のヘアピン配列が、ヒトにおいてはsnoRNA、scaRNAの検出が可能です。

アレイ種 3'IVT Array Gene ST Array Clariom S Array Clariom D Array
対応生物種数 24生物種 24生物種(27アレイ) ヒト・マウス・ラット ヒト・マウス・ラット
遺伝子・転写産物あたりの
設計プローブ数
22(ミスマッチプローブ含む) 平均26 10(各スプライスバリアントに共通した
エクソン領域内に設計)
エクソンあたり: 約10個
ジャンクション部あたり: 約4個
プローブデザイン
PM:検出用プローブ
MM:バックグラウンド用プローブ
PM/MM PMのみ PMのみ PMのみ
特長 ・多数の解析実績
・幅広い生物種に対応
・検出フラグデータによりノイズデータの除去が容易
・幅広い生物種に対応
・non-coding RNAの検出も可能
・最新の遺伝子情報に基づいたプローブ設計
・充分にアノテーション付けされた遺伝子のみ搭載で、
実験結果の解釈に困らない
・エクソン単位でのデータ比較
・100万個以上のデータ量(ヒト)

GeneChip 遺伝子発現解析用アレイリスト

解析結果

解析報告書およびDVD-ROMなどの記憶媒体に解析データを収録して納品します。

Transcriptome viewer
Transcriptome viewer
  • GeneChipシステム形式データ
    解析システムより産生されるCEL・CHP・TXTファイルは、論文投稿時に必要な公的データベースへのアップロードの際に必要になるデータです。
  • 総合比較解析用データ
    各サンプルの各遺伝子・転写産物・miRNA種の発現値、検出フラグデータ(一部のアレイのみ対応)が確認できます。弊社開発の「Transcriptome Viewer」を利用いただくことで、統計解析によるサンプル間の遺伝子発現比較、発現変動遺伝子の抽出(フィルタリング)、データのグラフ化・可視化(散布図、クラスタリング)などが可能になります。本ツールによりマイクロアレイ解析後の2次解析をスムーズに進めることができます。

必要サンプル条件

Total RNA: 500ng 以上(濃度50ng/uL以上)
RNA純度(A260/A280): 1.9~2.1

ご注意

※サンプルはヌクレアーゼフリー水に溶解してください。

※サンプルが上記規定に満たない場合は、お気軽にお問い合わせください。

※RNA抽出サービス(オプション)もご利用いただけます。

※miRNA Array解析の場合。Total RNAに低分子RNAが含まれている必要があります。
スピンカラムタイプのRNA抽出キットは低分子RNAが得られないタイプがありますのでご注意ください。

解析費用

アレイによって異なります。お問い合わせフォームより解析希望のアレイ種と検体数をお知らせください。営業担当より解析費用をご案内します。

納期

ご注文(サンプルの受領)より約4週間となります。アレイ種によっては取り寄せが必要になる場合があります。

ご依頼方法

解析依頼書の確認事項に同意・捺印いただいた上で、ご所属・ご氏名・サンプル情報などの必要事項をご記入いただき、サンプルと合わせてお送りください。
解析依頼書はこちら

サンプル送付方法

サンプルは十分量のドライアイスを同梱し、下記宛先まで冷凍便にてお送りください。

〒572-0823
大阪府寝屋川市下木田町14-5クラボウ寝屋川テクノセンター3F
クラボウ バイオメディカル部
遺伝子受託解析グループ 宛
TEL 072-820-3093

詳しい送付方法はこちら

※弊社では土日・祝日のサンプル受け取りはできませんので、避けてお送りください。

※サンプルの返却につきましてはお受けできません